Fastq QC

Análisis de calidad de archivos de secuenciación masiva en formato FASTQ

Este flujo de trabajo realiza una inspección de la calidad de archivos de secuenciación masiva en formato FASTQ.

El flujo está compuesto por los siguentes archivos:

• Archivo main.nf
  Archivo principal con el flujo de trabajo de nexflow.
• Archivo nexflow.config
  Archivo con la información de configuración del flujo.
• Archivo sample_info.tsv Archivo con el nombre y la ruta absoluta de los archivos FASTQ.
• Modulos de con los procesos de NextFlow Dento de la ruta ../modules/qualitycontrol/ se encuentran los modulos de nextflow, un archivo .nf por proceso.