生物信息学自学资料推荐,up主,公众号等
- 国内教育现状,大学生现状,生命学科现状,生物技术,生物医学工程,生物制剂等学科本科就业现状不过多阐述。
- 生物信息学是什么?
- 新冠病毒的测序,普通人的核酸检测,Alpha Fold预测蛋白质结构,备孕时的遗传病咨询,基因编辑治疗等,哪些是生物信息学,哪些是生物信息学交叉,哪些是计算生物学?
- 具体明确的概念或许并不重要,在交叉学科逐渐发展的今天,做什么,用什么方法,学什么,怎么学也非常重要。
- 学习路线图:
- 资源推荐
- 基础知识:线性代数,概率论和数理统计,微积分等;linux,Python,R等;细胞生物学,生物化学,免疫学等;深度学习,机器学习等
#环境配置,设备推荐
1.windows系统新手基础软件,环境安装
https://github.com/GoldenJin24/The-basic-operation-of-a-new-computer
#基础知识
1.krahets(github id)——数据结构
https://www.hello-algo.com/chapter_preface/about_the_book/
2.线性代数——《线性代数及其应用(机械工业出版社)》
3.菜鸟教程——Python,Linux学习
4.机器学习西瓜书
5.信息论课程
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#生物信息学,基因组学概念相关
1.章张老师——基因组学
https://www.bilibili.com/video/BV1KE421g7kT?p=1
2.张弓老师——生物信息学
https://www.bilibili.com/video/BV1VD4y1o7Lw/?spm_id_from=333.788.recommend_more_video.0&vd_source=2d43a2b523bdc656d5ec18e5231d85c3
3.卢杨老师——深度学习
https://www.bilibili.com/video/BV1qq4y1f7Fm/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=2d43a2b523bdc656d5ec18e5231d85c3
#实战,码代码
1.刘洪普老师——《PyTorch深度学习实践》
https://www.bilibili.com/video/BV1Y7411d7Ys/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=2d43a2b523bdc656d5ec18e5231d85c3
2.李沐老师——《动手学深度学习》
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3.生信技能树——微信公众号
略
4.蓝斯诺特——Pytorch教程和入门
https://www.bilibili.com/video/BV17X4y1H7dK/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=2d43a2b523bdc656d5ec18e5231d85c3
4.scverse(b站id)——单细胞转录组(scRNA-seq)全流程分析-最佳实践
https://www.bilibili.com/video/BV1m34y1i7Vf/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=2d43a2b523bdc656d5ec18e5231d85c3
5.单细胞测序实战
https://single-cell-tutorial.readthedocs.io/zh/latest/
5.Lu lab——生信教程
https://book.ncrnalab.org/teaching