FSE-ontology

Prerequisiti

• Stardog: istanza avviata e raggiungibile all'indirizzo http://localhost:5820
• Node.js e NPM: è possibile verificare l'installazione con i comandi node -v e npm -v

Setup

• Clonare la repo (qualora non fosse già disponibile in locale)

  git clone https://github.com/FrancescoBoschi/FSE-ontology.git
  

• Utilizzando Stardog Studio http://stardog.studio:

  • Creare un nuovo database con il nome fse

  • Importare i namespace dal file fse_namespaces.ttl nella repository

  • Importare le seguenti ontologie esterne:

    • Disease Ontology (doid)
    • Drug Ontology (dron)
    • Friend of a Friend (foaf)
    • LOINC (loinc)
    • ORG (org)

    Le versioni delle ontologie utilizzate per il progetto sono disponibili all'indirizzo https://drive.google.com/drive/folders/1GFto2GoLGlaf-MHzgDcVUAqTOCW_1k0d?usp=sharing.
    Le ontologie dron e loinc contengono una quantità elevata di dati. In caso di problemi nell'importazione è possibile utilizzare il sistema anche senza di esse con alcune funzionalità limitate.

  • Creare un nuovo model con nome fse e IRI https://fse.ontology

  • Sostituire il contenuto della sezione Text Editor con quello del file fse_https __fse.ontology_.ttl nella repository

  • Opzionale: per inserire alcuni dati nell'ontologia è possibile eseguire la query contenuta nel file insert-data-fse.rq nella repository

• Aprire un terminale nella cartella solid-fse della repository e utilizzare i seguenti comandi

  # Installazione delle dipendenze
  npm i
  # Avvio del programma
  npm run start

• L'applicativo Solid FSE è ora raggiungibile all'indirizzo http://localhost:8080