city_code.csv の code 列に先頭が 0 の市区町村コード(北海道~栃木県の市区町村)を記載した場合、[01_農地ピン-GeoJSON を WAGRI API で取得ツール] にて先頭の 0 が欠けてしまう。 [WAGRI_AgriLandPin_toolbox.pyt の 368 行目](https://github.com/EsriJapan/agricultural-land-tools/blob/main/WAGRI_AgriLandPin_toolbox.pyt#L368)を df['code'].astype(str).str.zfill(5) にする等で修正できるかと思います。