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Introducción al Diseño de Fármacos

Profesora: Dra. Ana Julia Velez Rueda

Este material está diseñado para el contexto de trabajo aúlico de la cátedra del curso Introducción a la Farmacología. El desarrollo racional de fármacos asistido por herramientas computacionales representa una de las áreas de mayor crecimiento y convergencia interdisciplinaria dentro de la bioinformática moderna. En contraste con los métodos tradicionales de descubrimiento de fármacos basados en ensayos masivos, el enfoque computacional permite optimizar tiempo, costos y recursos, enfocándose en la selección y validación de blancos terapéuticos clave mediante el análisis de datos ómicos, estructurales y funcionales. Este curso propone una mirada “target-centric” o en español centrado en la diana, orientada a la comprensión y caracterización profunda de los blancos moleculares implicados en patologías humanas, desde su identificación en datos transcriptómicos y proteómicos hasta su modelado estructural y posterior exploración como candidatos a la interacción con moléculas bioactivas. Se incluye una base conceptual en farmacología molecular y proteómica, brindando al estudiante el contexto necesario para interpretar las relaciones estructura-función de proteínas y su relevancia terapéutica. A su vez, se introducen herramientas bioinformáticas modernas para análisis de interacción proteína-ligando, dinámica molecular, predicción de propiedades ADMET y priorización de compuestos. La materia está diseñada para estudiantes con interés en bioinformática estructural, biología computacional, biotecnología farmacéutica o ciencias biomédicas, con aplicaciones tanto académicas como industriales (biotech y pharma).

PROGRAMA

Módulo	Temas	Enlace
Introducción a la farmacología y fisiopatología molecular	- Introducción a la fisiopatología molecular. - Farmacología básica y mecanismos de acción de fármacos. - Fisiología celular y humana	https://github.com/AJVelezRueda/Introduccion_a_la_Farmacologia/blob/master/Trabajos_pr%C3%A1cticos/TP_N1.md
Farmacocinética	- Absorción, distribución, metabolismo, excreción, toxicidad. - Filtros de Lipinski, Veber, PAINS. - Nanomedicina y bioinformática.	https://github.com/AJVelezRueda/Introduccion_a_la_Farmacologia/blob/master/Trabajos_pr%C3%A1cticos/TP_N2.md
Introducción al diseño de fármacos asistido por computadora	- Diseño racional de fármacos: enfoques basados en blanco vs. ligando. - Pipeline general: identificación del blanco, modelado, docking, filtrado, optimización. - Rol de la bioinformática y ventajas comparativas. - Estructura química de fármacos y propiedades fisicoquímicas relevantes. - Producción de medicamentos a gran escala.	---
Descubrimiento y validación de blancos	- Uso de transcriptómica y proteómica para encontrar blancos. - Redes de interacción proteína-proteína (PPI). - Priorización de targets basada en datos ómicos y bibliografía. - Conceptos básicos de evolución y asignación por homología. - Anotación de blancos moleculares y sitios de interés.	---
Análisis estructural del blanco	- Estructura de proteínas: niveles estructurales, dominios funcionales. - Búsqueda de estructuras en PDB. - Modelado por homología. - Métodos basados en AI para el modelado proteico. - Validación y exploración de modelos. - Análisis de sitios activos, pockets y superficies.	---
Técnicas de acoplamiento molecular	- Principios del docking molecular. - Métodos de scoring y evaluación de poses. - Cribado virtual con bibliotecas de compuestos. - Limitaciones y fuentes de error.	---
Reposicionamiento de fármacos y Farmacopatología	- Reposicionamiento: conceptos y estrategias. - Casos de éxito. - Análisis de fármacos conocidos sobre nuevos blancos. - Farmacopatología: reacciones adversas a medicamentos (RAM), predicciones computacionales.	---