Fix for PT_ratio to pt_ratio

Author: kabilar

element_array_ephys/ephys_acute.py

@@ -1360,6 +1360,7 @@ def make(self, key):
         metrics_df = pd.read_csv(metric_fp)
         metrics_df.set_index("cluster_id", inplace=True)
         metrics_df.replace([np.inf, -np.inf], np.nan, inplace=True)
+        metrics_df.columns = map(str.lower, metrics_df.columns)
 
         metrics_list = [
             dict(metrics_df.loc[unit_key["unit"]], **unit_key)

element_array_ephys/ephys_chronic.py

@@ -1289,6 +1289,7 @@ def make(self, key):
         metrics_df = pd.read_csv(metric_fp)
         metrics_df.set_index("cluster_id", inplace=True)
         metrics_df.replace([np.inf, -np.inf], np.nan, inplace=True)
+        metrics_df.columns = map(str.lower, metrics_df.columns)
 
         metrics_list = [
             dict(metrics_df.loc[unit_key["unit"]], **unit_key)

element_array_ephys/ephys_no_curation.py

@@ -1300,6 +1300,7 @@ def make(self, key):
         metrics_df = pd.read_csv(metric_fp)
         metrics_df.set_index("cluster_id", inplace=True)
         metrics_df.replace([np.inf, -np.inf], np.nan, inplace=True)
+        metrics_df.columns = map(str.lower, metrics_df.columns)
 
         metrics_list = [
             dict(metrics_df.loc[unit_key["unit"]], **unit_key)

element_array_ephys/ephys_precluster.py

@@ -1276,6 +1276,8 @@ def make(self, key):
 
         metrics_df = pd.read_csv(metric_fp)
         metrics_df.set_index("cluster_id", inplace=True)
+        metrics_df.replace([np.inf, -np.inf], np.nan, inplace=True)
+        metrics_df.columns = map(str.lower, metrics_df.columns)
 
         metrics_list = [
             dict(metrics_df.loc[unit_key["unit"]], **unit_key)