chr labels order problem

[MooreZhu]

您好，师兄！我在绘制密度图的时候有2个问题，
1、我的染色体中有一些是scaffold，我设置了因子，但是他们在图上的显示是sca1、sca10，而不是按数字排序sca1、sca2，这个在CMplot包中可以设置么，或者您有推荐的解决方案么
2、绘图时染色体编号前会加上Chr，但是我的scaffold不想加这个标签，有办法设置么
谢谢师兄！

[YinLiLin]

1. 可以在画图之前把染色体编号替换成纯数字，然后把真实的labels向量传给参数chr.labels
2. 默认自动添加chr，你可以把源码下载下来，把L462中的paste("Chr", chr.num, sep="")改成chr.num，本地source使用即可

[MooreZhu]

您好，师兄！我在作单独的一条染色体的曼哈顿图时，我的染色体号应该是5A（物种是小麦），但是这里却显示成了chr.1，这是为什么呢？其他的染色体似乎也有相同的问题？请问您有解决方案么？
谢谢师兄！

[YinLiLin]

方便把你的数据和运行代码发给我调试看看吗？